Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smu1Q3UKJ7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms