Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Greb1Q3UHK3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Greb1Q3UHK3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms