Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zswim8Q3UHH1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zswim8Q3UHH1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zswim8Q3UHH1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms