Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnft2Q3UF64 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms