Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf180Q3U827 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf180Q3U827 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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