Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U595 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U595 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U595 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U595 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U595 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U595 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U595 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U595 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U595 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U595 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U595 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U595 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U595 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3U595 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q3U595 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q3U595 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q3U595 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q3U595 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q3U595 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U595 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U595 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U595 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U595 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U595 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U595 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U595 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U595 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U595 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U595 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U595 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U595 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q3U595 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms