Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm4dQ3U2K5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kdm4dQ3U2K5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm4dQ3U2K5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms