Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1Y4

Dennd4b, DENN domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dennd4bQ3U1Y4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dennd4bQ3U1Y4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms