Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc174Q3U155 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc174Q3U155 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms