Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd1Q3TXS7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd1Q3TXS7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms