Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Calr4Q3TQS0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Calr4Q3TQS0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms