Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp39Q3TIX9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms