Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem248Q3TBN1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms