Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap5b1Q3TAP4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap5b1Q3TAP4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap5b1Q3TAP4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap5b1Q3TAP4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap5b1Q3TAP4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap5b1Q3TAP4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap5b1Q3TAP4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap5b1Q3TAP4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap5b1Q3TAP4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap5b1Q3TAP4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms