Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Jmjd8Q3TA59 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Jmjd8Q3TA59 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Jmjd8Q3TA59 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Jmjd8Q3TA59 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Jmjd8Q3TA59 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd8Q3TA59 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms