Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hddc2Q3SXD3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms