Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defb33Q30KN3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defb33Q30KN3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms