Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rpusd3Q14AI6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rpusd3Q14AI6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Rpusd3Q14AI6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rpusd3Q14AI6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rpusd3Q14AI6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rpusd3Q14AI6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rpusd3Q14AI6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd3Q14AI6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rpusd3Q14AI6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rpusd3Q14AI6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rpusd3Q14AI6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rpusd3Q14AI6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rpusd3Q14AI6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rpusd3Q14AI6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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