Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp4r2Q0VGB7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms