Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm1Q0GA42 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm1Q0GA42 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms