Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms