Protein–RNA interactions for Protein: Q08288

Lyar, Cell growth-regulating nucleolar protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LyarQ08288 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LyarQ08288 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LyarQ08288 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LyarQ08288 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LyarQ08288 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LyarQ08288 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LyarQ08288 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LyarQ08288 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LyarQ08288 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LyarQ08288 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LyarQ08288 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LyarQ08288 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LyarQ08288 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LyarQ08288 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LyarQ08288 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LyarQ08288 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LyarQ08288 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms