Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AmbpQ07456 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AmbpQ07456 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms