Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fmn1Q05860 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Fmn1Q05860 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms