Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox12Q04890 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms