Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox10Q04888 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms