Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox8Q04886 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms