Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelbQ04863 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelbQ04863 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelbQ04863 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms