Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Emx2Q04744 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Emx2Q04744 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Emx2Q04744 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Emx2Q04744 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Emx2Q04744 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Emx2Q04744 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Emx2Q04744 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms