Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarcad1Q04692 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smarcad1Q04692 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms