Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GscQ02591 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GscQ02591 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GscQ02591 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GscQ02591 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GscQ02591 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GscQ02591 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GscQ02591 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GscQ02591 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GscQ02591 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GscQ02591 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GscQ02591 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GscQ02591 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GscQ02591 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GscQ02591 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GscQ02591 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GscQ02591 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GscQ02591 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GscQ02591 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GscQ02591 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GscQ02591 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GscQ02591 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GscQ02591 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GscQ02591 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GscQ02591 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GscQ02591 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GscQ02591 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GscQ02591 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GscQ02591 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GscQ02591 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GscQ02591 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GscQ02591 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GscQ02591 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GscQ02591 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GscQ02591 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GscQ02591 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GscQ02591 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GscQ02591 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GscQ02591 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GscQ02591 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GscQ02591 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GscQ02591 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GscQ02591 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GscQ02591 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GscQ02591 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GscQ02591 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GscQ02591 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GscQ02591 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GscQ02591 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GscQ02591 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GscQ02591 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GscQ02591 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms