Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nhlh1Q02576 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlh1Q02576 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms