Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pdcd1Q02242 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms