Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms