Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snai1Q02085 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms