Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ly9Q01965 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms