Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RykQ01887 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RykQ01887 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RykQ01887 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RykQ01887 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RykQ01887 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RykQ01887 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RykQ01887 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RykQ01887 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RykQ01887 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RykQ01887 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RykQ01887 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RykQ01887 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RykQ01887 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RykQ01887 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RykQ01887 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RykQ01887 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RykQ01887 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RykQ01887 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RykQ01887 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RykQ01887 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RykQ01887 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RykQ01887 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RykQ01887 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RykQ01887 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RykQ01887 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RykQ01887 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RykQ01887 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RykQ01887 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RykQ01887 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RykQ01887 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RykQ01887 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RykQ01887 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RykQ01887 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RykQ01887 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RykQ01887 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RykQ01887 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RykQ01887 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RykQ01887 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RykQ01887 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RykQ01887 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RykQ01887 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RykQ01887 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RykQ01887 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RykQ01887 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RykQ01887 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RykQ01887 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RykQ01887 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RykQ01887 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RykQ01887 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RykQ01887 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RykQ01887 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RykQ01887 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RykQ01887 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RykQ01887 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RykQ01887 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RykQ01887 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RykQ01887 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms