Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd1Q01822 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms