Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2cQ01098 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grin2cQ01098 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms