Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms