Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeleQ00690 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SeleQ00690 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SeleQ00690 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SeleQ00690 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SeleQ00690 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SeleQ00690 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SeleQ00690 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SeleQ00690 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms