Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HmmrQ00547 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms