Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab33aP97950 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab33aP97950 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms