Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AlkP97793 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AlkP97793 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AlkP97793 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
AlkP97793 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AlkP97793 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AlkP97793 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AlkP97793 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AlkP97793 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AlkP97793 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AlkP97793 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
AlkP97793 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AlkP97793 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
AlkP97793 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AlkP97793 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AlkP97793 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AlkP97793 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AlkP97793 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AlkP97793 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AlkP97793 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AlkP97793 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AlkP97793 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AlkP97793 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AlkP97793 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AlkP97793 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AlkP97793 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AlkP97793 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AlkP97793 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlkP97793 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlkP97793 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlkP97793 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlkP97793 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlkP97793 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlkP97793 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlkP97793 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlkP97793 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlkP97793 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlkP97793 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlkP97793 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlkP97793 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AlkP97793 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AlkP97793 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AlkP97793 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AlkP97793 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AlkP97793 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AlkP97793 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AlkP97793 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AlkP97793 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AlkP97793 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AlkP97793 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AlkP97793 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AlkP97793 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
AlkP97793 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AlkP97793 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AlkP97793 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AlkP97793 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AlkP97793 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AlkP97793 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AlkP97793 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AlkP97793 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AlkP97793 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AlkP97793 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AlkP97793 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AlkP97793 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AlkP97793 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AlkP97793 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AlkP97793 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AlkP97793 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AlkP97793 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AlkP97793 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AlkP97793 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AlkP97793 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AlkP97793 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AlkP97793 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AlkP97793 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AlkP97793 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AlkP97793 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AlkP97793 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AlkP97793 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AlkP97793 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AlkP97793 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AlkP97793 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
AlkP97793 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AlkP97793 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AlkP97793 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AlkP97793 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AlkP97793 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AlkP97793 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
AlkP97793 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AlkP97793 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AlkP97793 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AlkP97793 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
AlkP97793 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AlkP97793 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AlkP97793 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AlkP97793 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AlkP97793 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AlkP97793 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AlkP97793 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AlkP97793 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms