Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gfra1P97785 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms