Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitx2P97474 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms