Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4cP97470 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ppp4cP97470 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4cP97470 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4cP97470 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4cP97470 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4cP97470 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4cP97470 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4cP97470 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4cP97470 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp4cP97470 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp4cP97470 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp4cP97470 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms