Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nbr1P97432 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms