Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b3P97370 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms