Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3f3aP84244 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms